Alytaus miesto savivaldybės administracijai vadovauja administracijos direktorius, kuriam yra pavaldūs du pavaduotojai, 19 skyrių, savivaldybės gydytojas (vyr. specialistas), kalbos tvarkytojas, vyr. specialistas jaunimo reikalų koordinatorius, vyr. specialistas tarpinstitucinio bendradarbiavimo koordinatorius, asmens duomenų apsaugos pareigūnas (vyr. specialistas) ir savivaldybės administracijos pavaldžios įstaigos.

Alytaus miesto savivaldybės administracijos organizacinė schema

•    sveikatos priežiūros įstaigos (5 vnt.), kuruojamos savivaldybės gydytojo;
•    kultūros įstaigos (5 vnt.), kuruojamos Kultūros skyriaus;
•    2 sporto ir turizmo įstaigos, kuruojamos Sporto ir rekreacijos skyriaus;
•    socialinių paslaugų įstaigos, kuruojamos Socialinės paramos skyriaus;
•    13 ikimokyklinio ugdymo įstaigų, kuruojamų Švietimo skyriaus;
•    17 bendrojo lavinimo įstaigų, kuruojamų Švietimo skyriaus;
•    neformaliojo švietimo įstaigos, kuruojamos Švietimo skyriaus;
•    kitos paskirties įstaigos, kuruojamos Miesto ūkio skyriaus ar tiesiogiai administracijos direktoriaus.

Administracijai pavaldžių įstaigų organizacinė struktūra